淮安市第一人民醫院內分泌科創建于20世紀70年代，經過幾代人的努力已發展為蘇北地區實力較強的集臨床、教學和科研為一體的內分泌與代謝性疾病診治中心之一。內分泌科是江蘇省臨床重點專科，南京醫科大學和徐州醫科大學碩士研究生指導教師單位，國家代謝性疾病臨床醫學研究中心協調研究網絡成員單位，國家級骨質疏松防治基地，國家級藥物臨床研究機構科室，中華醫學會糖尿病學分會糖尿病健康教育管理示范單位，長三角骨質疏松防治聯盟單位，江蘇省衛健委基層內分泌特色科室分孵化中心，東南大學附屬中大醫院糖尿病足專病聯盟副理事長單位，江蘇省1型糖尿病質控協作組首批核心成員單位。在省內具有具有較高的聲譽，近五年，內分泌科多次進入艾力彼“中國地市級城市醫院綜合競爭力”百強榜前30強，排名逐漸上升，2022年位列第23名。
科室分設下丘腦-垂體疾病、腎上腺疾病、骨質疏松、肥胖癥和痛風亞專科，開啟甲狀腺、腎上腺、痛風、骨質疏松、青春發育、妊娠期糖尿病等多個專病門診。科室目前設兩個病區、現有床位120張，專科醫師28人，其中主任醫師7人，副主任醫師7人，博士后1人，博士16人。省級副主委1人，省常委1名，國家級、省市級委員8人。碩士研究生導師8人。專科護理人員36人，糖尿病專科護士6人。
科室在臨床工作中開展科學研究。近年來，已獲國家自然科學基金7項，省自然基金在內的省市級、南京醫科大學校基金課題20多項，獲得省、市級科研成果20多項，省市級新技術引進獎多項，完成國際多中心、國家級藥物臨床試驗70多項。